有疾控系統官員向紅星新聞記者表示，吳尊友的離開“是公衛領域的大損失”。

吳尊友的學生兼前同事、從事中國艾防事業的郭先生非常悲痛。他告訴紅星新聞記者，吳尊友沒有一天不在工作，“都不記得他生活是什么樣子了，好像他全部的時間都在工作。”新冠疫情期間，乃至患病期間，吳尊友也一直在常抓艾防工作，雙線作戰。

10月27日，中國疾控中心原主任、中國科學院院士高福這樣評價吳尊友：“是好同志，真正的流行病學家，是一個學者，我們應該學習他帶病工作的革命精神。”